Conrad “Duke” Hauser protagonizó el primer contacto con un cybertroniano y sobrevivió para contarlo. Ahora, uno de los soldados más condecorados del ejército de los Estados Unidos se embarca en una peligrosa misión en busca de respuestas, adentrándose en un conflicto para el que ningún tipo de entrenamiento le podría preparar. Mientras tanto, los siniestros planes de un hombre para utilizar la misteriosa sustancia alienígena conocida como Energon desatan una onda expansiva alrededor del planeta. ¿Quién es el Comandante Cobra y qué clase de horrores está dispuesto a desatar en la Tierra?
El guionista superestrella Joshua Williamson (Batman y Robin, Superman) forma equipo creativo con los dibujantes Tom Reilly y Andrea Milana para presentar a dos de las facciones más poderosas del Universo Energon, donde conviven Transformers y G.I. Joe.